VR:n makasiinien eteläinen siipi paloi näyttävästi Helsingin Töölönlahdella 5. toukokuuta 2006. Tulipalo hävitti VR:n makasiinit vuosikausien suojelukiistan päätteeksi.

Helsingin Sanomien kaupunkitoimittaja Kimmo Oksasen kirja Makasiinit (1899–2006) kertoo VR:n makasiinien sadan vuoden historian ensimmäisen tiilen muurauksesta tulimereen.